Plateforme de spectrométrie de masse

Spectrométrie de masse

 La plateforme offre une expertise en spectrométrie de masse et peut assister les scientifiques dans leurs analyses protéomiques, qu’il s’agisse de protéines purifiées ou d’échantillons protéiques complexes.

 Nos services vont du simple contrôle de qualité des protéines recombinantes et de l’identification des protéines à la quantification relative des protéomes et à la caractérisation des modifications post-traductionnelles.

La plateforme réalise régulièrement des expériences de quantification sans marquage, mais aussi des analyses de quantification relative après marquage chimique ou métabolique (p. ex. SILAC). Les analyses de données sont effectuées avec les logiciels MaxQuant/Perseus ou ProteomeDiscoverer. Selon la nature de l’analyse, l’échantillon fourni sera sous forme liquide ou dérivé d’un gel SDS-PAGE. Nous pouvons également conseiller et former les chercheurs et les étudiants à la préparation des échantillons et à l’analyse des résultats.

 

Contact

Responsable scientifique 

Christophe MARCHAND
IR CNRS – UMR 8226
 

Ingénieur plateforme 

Marion HAMON
IE CNRS – FR 550

Mail   : proteomics@ibpc.fr

Actualités

Poster : Proteomic Platform (IBPC) : a mass spectrometry facility open to the scientific community

Newsletter des plaeteformes de l’IBPC 1

Equipements

 La plateforme est équipée de deux spectromètres de masse : un MALDI-TOF/TOF Axima Performance (Shimadzu) et un système d’électrospray Q-Exactive plus couplé à un système de chromatographie liquide à ultra-haute performance Vanquish Neo nano-flow acquis en 2023 (Thermofisher Scientific), ainsi qu’un système HPLC conventionnel (détecteurs UV et DAD).

Système HPLC permettant une chromatographie préparative et analytique.

Spectromètre de masse en tandem neuf à très haute résolution Q Exactive (Thermoscientific) couplé en amont à une nano-chromatographie liquide à ultra haute performance Nano Easy1000 (Thermoscientific).

Spectromètre de masse MALDI-TOF/TOF Axima Performance (Shimadzu)

Réservation

Interne IBPC
Un planning de réservation du MALDI-TOF est désormais disponible en ligne pour le personnel formé de l’IBPC. Pensez à réserver.

https://resa-equipement.ibpc.fr/

Externe IBPC
Pour toute demande de réservation externe à l’IBPC, ou pour toute demande de formation contacter :

proteomics@ibpc.fr

Analyses

La plateforme propose différents types d’analyses :

  • Préparation d’échantillon Digestion gel d’électrophorèse (spot ou bande)
  • Digestion en solution
  • Purification de peptides C18
  • Identification de protéines purifiées
    (mélange peptidique simple)
  • Identification de protéines en mélange complexe (séparation chromatographique préalable)
  • Mesure de masse sur protéine entière
    (en solution)
  • Protéomique quantitative : développement de techniques type label free

Des protocoles sont disponibles ci-dessous mais une prise de contact avec le plateau est recommandée avant toute préparation d’échantillon.
Pour toute demande d’analyse contacter : proteomics@ibpc.fr

Remerciements & Tarification

Avec la diversité de la plateforme, trois grilles tarifaires ont été établies selon la décision tarifaire DEC247241DR02 :
– Maldi-TOF ;
– préparation des échantillons ;
– analyse Qexactive.

Type d’analyse Facturation interne-
clients partenaires
Clients externes
académiques
Clients privés
Analyse MALDI-TOF
14.38 €
62.26 €
90.04 €
Préparation d’échantillon
1.37 €
43.56 €
56.63 €
Analyse Q-Exactive
96.10 €
299.65 €
389.55 €

Merci aux utilisateurs de la plateforme d’inclure pour toute publication utilisant des résultats acquis grâce à la plateforme de protéomique de l’IBPC la phrase suivante :

The authors acknowledge access to the proteomic platform of the IBPC that is supported by the CNRS, the Labex DYNAMO (ANR-11-LABX-0011), the Equipex CACSICE (ANR-11-EQPX-0008) and the CPER PSLRESOLUTION.

Label

La plateforme est labellisé IBiSA depuis janvier 2025.

Actualités de la plateforme

Liste de publications

5511665 82TPS5CH Mass_plateforme 1 apa 50 date desc year 2071 http://www.ibpcwp.ibpc.fr/wp-content/plugins/zotpress/